1959 metais buvusios Markutiškių RTS bazėje buvo įkurta Jonavos melioracijos mašinų stotis ( MMS). Jai besikuriant, buvo panaikintas Jonavos rajonas, o kartu ir MMS. 1964 metais Jonavos rajonas vėl buvo atkurtas, o 1965 metų vasario 1 d. buvo įsteigta Jonavos melioracijos statybos valdyba toje pačioje Markutiškių bazėje. Didinant darbų apimtis, buvo nutarta išplėsti ir gamybinę bazę, perkeliant ją į Jonavos miestą. 1971 metais buvo pastatytas valdybos administracinis pastatas ir autogaražas, o vėliau ir modernios remonto dirbtuvės, sandėliai. 1994 metais Jonavos melioracijos statybos valdyba buvo privatizuota ir tapo AB ,,Jonavos hidrotechnika“. 2004 metais reorganizuota į UAB ,,Jonavos hidrotechnika“.